A prioridade é testar professores e auxiliares educativos de todas as escolas dos três concelhos com mais casos por 100 mil habitantes.
Cerca de 6 mil pessoas serão submetidas ao teste rápido.
As escolas vão reabrindo de forma gradual. Algumas já podem funcionar esta semana.
Para já os alunos ficam de fora do rastreio à covid-19.
O governo tenciona ter todas as escolas a funcionar em pleno na segunda-feira dia 11.
Um encarregado de educação por agregado familiar pode ficar a tomar conta dos menores de doze anos.
Enquanto não houver regresso presencial, as escolas podem optar pelo ensino à distância.
Cerca de 30 mil estudantes ficam em casa no primeiro dia de aulas do ano novo.
Os testes a professores e auxiliares educativos iniciam-se esta segunda-feira.