Durante a missão o navio irá estar empenhado em diversas tarefas essencialmente vocacionadas para funções de segurança e autoridade do Estado do Mar.
A missão permanente da Marinha na região tem como principal objetivo assegurar a capacidade de resposta em situações de busca e salvamento marítimo, contribuir para o esforço de patrulhamento marítimo, apoiar órgãos de proteção civil regionais em situações de calamidade ou catástrofes naturais e cooperar com outros departamentos do Estado com competências no mar.
O NRP Mondego substitui o NRD douro, que largou ontem, do porto do Funchal para a Base Naval de Lisboa.
