O major é Vice-presidente do Comité Estratégico do Painel de Investigação dedicado à Tecnologia Aplicada a Veículos. E tem contribuído para o avanço da NATO no domínio dos veículos aéreos não-tripulados.
Atualmente João Caetano está a desenvolver tecnologia para ajudar a prever o caminho das chamas durantes os incêndios florestais, com recurso a drones.
João Caetano fez um doutoramento no desenvolvimento de sistemas áreas não tripulados parecidos com insetos.