O piloto luso da marca austríaca fez a sua melhor volta em 1.55,895 minutos, terminando a 0,681 segundos do mais rápido, o espanhol Marc Márquez (Honda).
O francês Johann Zarco (Ducati) foi o segundo, a 0,208 segundos, com o sul-africano Brad Binder (KTM) em terceiro, a 0,323 segundos.
Miguel Oliveira sai, assim, da terceira linha da grelha de partida, depois de ter sofrido uma queda quando faltavam apenas três minutos para o final de uma sessão que ficou marcada pela chuva, que provocou um atraso superior a uma hora e já tinha obrigado ao cancelamento da terceira sessão de treinos livres, durante a madrugada.
A queda do piloto português aconteceu no terceiro setor da pista, numa altura em que vinha a melhorar os seus tempos.
Quando os 15 minutos desta segunda fase da qualificação (Q2) se esgotaram, Oliveira era quarto classificado.
Contudo, vários pilotos vinham ainda a meio da última volta lançada e o piloto de Almada acabou superado pelo espanhol Jorge Martin (Ducati), por Brad Binder e pelos espanhóis da Aprilia Aleix Espargaró e Maverick Viñales.
A pole position acabou por ser conquistada por Marc Márquez 1071 dias depois de ter sido o mais rápido em qualificação numa prova do Mundial de MotoGP, precisamente no GP do Japão mas de 2019.
"Estou muito feliz pela pole. Esta manhã senti-me muito forte com a pista molhada e decidi tentar. É muito importante para nós e para o futuro. Amanhã, com o piso seco, será uma história diferente", frisou o piloto espanhol, que já foi oito vezes campeão do mundo.
A chuva que se abateu sobre o traçado de Motegi foi uma dor de cabeça para pilotos e organização, que se viu obrigada a interromper a qualificação de Moto2 quando ainda faltavam nove minutos para o seu final, e a cancelar a terceira sessão de treinos livres de MotoGP.
A ação em pista só foi retomada mais de uma hora depois, com a pista ainda molhada a provocar várias quedas, incluindo a do piloto português da KTM, que deslizou para fora do asfalto, sem consequências físicas.
A Ducati de Johann Zarco foi hoje a mais rápida, batendo os 302 quilómetros por hora, com a KTM de Oliveira a perder 30 quilómetros por hora em reta (a velocidade máxima atingida pelo luso foi de 270 quilómetros por hora). Já a Ducati de Luca Marini foi a mais lenta, não indo além dos 255,9 quilómetros por hora, deixando o italiano no 10.º lugar.
O campeão e líder do campeonato, o francês Fábio Quartararo (Yamaha) foi nono classificado, atrás de Miguel Oliveira, enquanto o segundo classificado do Mundial, o italiano Francesco Bagnaia (Ducati) foi o 12.º e último desta Q2, que reúne os 10 mais rápidos dos treinos livres e os dois melhores da Q1.
Já o italiano Enea Bastianini (Ducati), vencedor da ronda anterior, em Aragão, ficou-se pela Q1, onde sofreu uma queda, sem consequências físicas.